从新疆维吾尔自治区卫生厅了解到，从二00五年九月至二00六年九月，新疆新增艾滋病感染者近六千例，日增加近十七例。
据新疆卫生部门统计资料显示，截至二00六年九月三十日，新疆各地累计报告艾滋病感染者一万七千多例，其中艾滋病病例七百多例，死亡一百多例，位居中国第四，约占全国总报告人数的百分之十。
在艾滋病疫情比较严重的新疆伊犁地区，孕产妇的艾滋病感染率达到了百分之一，在这些人中，大多是因为丈夫吸毒后感染艾滋病、再通过性传播途径感染妻子。更让人担忧的是，这些孕妇面临着生产，相关措施如果不到位，生出的婴儿绝大多数也将是艾滋病感染者。
新疆自一九九五年发现首例艾滋病病毒感染者以来，疫情发展速度较快。感染者主要分布于城市静脉注射吸毒人群，艾滋病感染向一般人群蔓延的趋势明显，感染者中以青壮年为主。
据当地卫生部门估计，新疆艾滋病感染者已超过六万，而且大多数早期感染者已陆续发病，未来几年，新疆将面临艾滋病感染者大面积发病危机。
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